作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
小麦是我国的主要粮食作物之一, 对国民经济发展具有显著的影响。 然而, 高温与紫外线胁迫导致其产量大幅下降。 胁迫发生时, 细胞壁内多糖物质会发生不同程度的转变。 作为此类多糖重要组成成分的果胶, 在决定细胞间孔隙度、 识别病菌、 维持结构完整等方面扮演着重要角色。 当前, 常见的果胶检测方法有重量法、 滴定法、 酸提取法等, 这些方法多为有损检测, 测定步骤繁琐, 样本损耗量大。 近年来, 光谱检测因其检测速度快、 分辨率高、 实时性强等优点, 在植物生理信息检测领域得到了广泛应用。 因此, 研究采用光谱检测果胶含量。 以济麦22为研究对象, 采取水培方式, 通过调控人工气候培养箱温度及紫外线灯辐照强度对小麦生长过程中遇到的高温及紫外线胁迫环境进行模拟; 在小麦分蘖期, 分别采集叶片高光谱数据与叶绿素荧光光谱数据, 测定叶片果胶含量, 通过小波分析方法对两种原始光谱数据进行平滑与降噪处理, 采用相关系数分析法得到两种光谱数据与果胶含量相关系数最高的重合波段(620, 651), 取该波段内两光谱数据平均值, 重塑双光谱曲线; 按照3∶1比例划分训练集和验证集, 采用PLS最小二乘法分别建立高光谱反演果胶模型、 荧光光谱反演果胶模型及双光谱反演果胶模型。 结果表明: 双光谱模型反演的小麦叶片果胶含量效果较好, 对应模型的训练集与验证集相关系数分别为0.944 9及0.944 5。 该研究有助于探究逆境胁迫下小麦细胞壁内多糖物质响应情况, 并为大田作物所处胁迫环境和程度的预测及种植环境的精准管控提供参考和帮助。
小麦 光谱技术 果胶 高温胁迫 紫外线胁迫 模型预测 Wheat Spectral technology Pectin High tempurature stress Ultraviolet stress Model predicton 
光谱学与光谱分析
2023, 43(9): 2705
作者单位
摘要
1 吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
2 吉林大学公共卫生学院, 吉林 长春 130021
斑病害在全球玉米产区均有爆发, 严重影响玉米产量与品质, 是一种常见的叶类疾病。 荧光光谱技术能够快速、 无损、 准确地反映作物生理信息, 动态检测其逆境响应规律。 以玉米为研究对象, 基于荧光光谱和生理参数(SPAD和Fv/Fm)融合分析, 探究玉米生理参数对不同程度斑病害的响应规律, 构建荧光光谱反演模型。 首先, 利用相关分析与峰值分析筛选荧光光谱的敏感波段, 采用多元散射校正(MSC)、 标准正态变量变换(SNV)、 多项式平滑(S-G)、 FD光谱一阶导数、 SD光谱二阶导数等5种预处理及MSC-SG-FD, MSC-FD-SG, SNV-SG-FD, SNV-SG-SD等4种建模组合方法, 以相关系数R2和均方根误差RMSE为模型效果评价指标, 确定荧光光谱反演生理参数模型的最优方法。 结果表明: 不同斑病害程度下荧光光谱特性的整体变化趋势一致, 但强度差异显著, 在波段600.000~800.000 nm内, 光谱反射率会出现明显的峰中心, 达到极值。 在波段900.000 nm之后, 反射率趋于平稳, 特征明显减少。 对于潜伏期叶片, SPAD与Fv/Fm的建模最优方法均为SNV-SG-FD, Rc为0.985 2和0.976 8, RMSEC为1.59和2.85。 对于早期发病叶片, SPAD的建模最优方法为SNV-SG-FD, Rc为0.949 7, RMSEC为3.79, Fv/Fm的建模最优方法为SNV-SG-SD, Rc为0.943 8, RMSEC为0.011 7。 模型预测性精度较高, 能够实现对早期斑病害玉米叶片SPAD和Fv/Fm的精准预测, 为玉米斑病害潜伏期与病害早期的生理信息监测提供参考依据。 研究结果可应用于大田作业, 提升田间精细化、 智能化管理水平, 为玉米高产、 优质、 优生提供理论依据与技术支撑。
玉米斑病害 荧光光谱 生理参数 建模方法 病害胁迫 Maize spot disease Fluorescence spectroscopy Physiological parameters Modeling methods Disease stress 
光谱学与光谱分析
2023, 43(12): 3710
作者单位
摘要
1 吉林农业大学园艺学院, 吉林 长春 130118
2 吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
3 吉林农业大学工程技术学院, 吉林 长春 130118
作物病害类型的快速无损检测对提高作物品质和产量至关重要。 传统的病害分类方法费时费力且不能实时检测。 为此, 利用高光谱进行大豆病害分类。 以健康大豆为对照, 灰斑病和细菌性斑点病两种病害为研究对象, 获取三种类别叶片高光谱数据。 基于高光谱曲线分析病害与健康叶片反射率的变化规律。 采用主成分分析(PCA)和光谱指数(SI)两种单一方法进行病害有效信息提取, 共使用30个SI。 在此基础上, 提出一种PCA与SI相结合的组合方法(PCA-SI), 通过提取有效主成分(PC)及有效SI, 将有效SI按得分情况分为两组(9SIs和18SIs), 再分别对应每一个有效PC进行分组, 形成病害光谱有效信息的变量集。 采用三种方法分别进行病害有效信息的提取, 基于提取后的光谱变量, 采用最小二乘支持向量机(LSSVM)和支持向量机(SVM)两种分类器建立病害分类模型。 以原始高光谱为基准, 以病害分类正确率为指标, 评价模型的病害分类性能及不同病害有效信息提取方法和分类器的有效性。 结果表明: 高光谱反射率具有可见光450~700 nm 波段范围病害叶片高于健康叶片而近红外760~1 000 nm波段范围其特征完全相反的规律。 采用单一PCA方法提取出了34个有效PC用于病害分类。 基于PCA-SI组合方法提取出5个有效PC(PC1—PC5)和18个有效SI, 将其进行分组得到10组变量, 共计13组变量作为建模集。 三种方法提取病害有效信息后的光谱变量均比原始高光谱具有更好的病害分类能力, 提出的PCA-SI组合方法具有最优的病害有效信息提取能力, PC1-18SIs和PC4-18SIs为最优建模集, LSSVM分类器具有最优的分类性能。 PC1-18SIs-LSSVM和PC4-18SIs-LSSVM模型为最优病害分类模型, 训练集和预测集的总病害分类正确率分别为100%和98.85%, 与原始高光谱分类模型相比, 总分类能力分别提高了6.47%和21.74%, 模型分类能力较好, 可为病害实时无损分类识别提供参考。
大豆 病害分类 高光谱 Soybean Disease classification Hyperspectral data 
光谱学与光谱分析
2023, 43(5): 1550
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
用光谱信息精准、 高效地检测水稻叶片叶绿素含量, 对诊断和优化水稻叶片氮素营养、 开发和优化稻田氮素追肥系统、 监测和评价水稻病虫害具有重要的实际意义。 针对单纯采用机器学习模型反演水稻叶片叶绿素含量模型精确性和稳定性差的问题, 以粳稻吉粳88为研究对象, 通过网格试验获得分蘖期等关键生育期的叶片表型高光谱数据和相对叶绿素含量。 选取核极限学习机(KELM)为基础建模模型, 提出了一种先依据基础KELM建模效果选择预处理方法后, 再利用仿生优化算法对所选预处理组合所对应的KELM模型的训练过程进行优化的新思路, 以提高模型预测精度。 首先, 对光谱数据的各类预处理方法展开研究, 通过对4类预处理方法进行全排列组合共得到72种预处理组合。 利用连续投影算法(SPA)选择特征波段输入KELM模型以筛选较优预处理组合。 依据建模效果, 预处理组合CWT+MMS, CWT+MSC+SG+SS和CWT+SS所对应KELM的测试集决定系数(R2p)较高, 分别为0.850, 0.835和0.828。 其次, 为使KELM模型在保证稳定性和泛化性的前提下性能达到最优, 引入哈里斯鹰优化算法(HHO), 通过模拟鹰群在捕食时的合作行为和追逐策略, 自动最优调节上述三种KELM模型参数, 使得HHO-KELM模型R2p分别为0.957, 0.867和0.858, 模型精度得到有效提升, 最高提升10.7%。 通过研究, 证明了HHO算法优化机器学习模型反演水稻叶片叶绿素含量的可行性, 为东北粳稻叶绿素含量的测定和评估提供了有力的参考和借鉴。
哈里斯鹰优化算法 核极限学习机 高光谱 叶绿素含量 Harris Hawk optimization algorithm Nuclear limit learning machine Hyperspectral Chlorophyll content 
光谱学与光谱分析
2023, 43(1): 93
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
利用高光谱反射率光谱的特征波段构建光谱指数, 建立叶绿素含量反演模型是实现水稻生产精准调控和科学管理的必要手段之一。 为了建立适用于拔节孕穗期水稻叶片叶绿素相对含量(SPAD)的高光谱反演模型, 分别获取了拔节孕穗期水稻叶片的高光谱和SPAD数据, 利用小波分析法对原始光谱反射率曲线进行降噪处理, 并对基于积分运算的光谱指数NAOC进行简化, 获得了基于双波段简化运算的优化光谱指数。 利用相关分析法计算由原始反射率光谱R和数学变换光谱LgR、 1/RR构建的优化光谱和变换光谱指数与水稻叶片SPAD的相关系数, 获得了以积分限(a, b)为横、 纵坐标的相关系数二维矩阵, 并绘制相关性等势图, 得到相关系数最高的3个波段组合: R(641, 790)(0.872 6), R(653, 767)(0.871 7)和R(644, 774)(0.871 6), 计算出20个原始样本中3个积分波段组合所对应的60个优化光谱指数值, 按照2:1的比例划分为建模集和验证集, 建立了三种水稻叶片SPAD反演模型: 偏最小二乘回归(PLSR)、 支持向量机(SVM)和BP神经网络模型。 结果显示: 利用优化光谱和变换光谱指数建立的3种水稻叶片SPAD反演模型决定系数R2均大于0.79, 归一化均方根误差NRMSE则小于5.4%。 其中BP神经网络相对于其他两种模型具有较高的拟合度, 预测精度也相对较高, 建模集R2=0.842 6, NRMSE=5.152 7%; 验证集R2=0.857, NRMSE=4.829 9%。 总体来看, 基于双波段简化运算后的优化光谱和变换光谱指数建立拔节孕穗期水稻叶片SPAD反演模型是可行的; 对比分析3种模型反演结果发现, BP神经网络对水稻叶片SPAD的反演效果较好。 该工作对提高拔节孕穗期水稻精准调控技术和建立水稻生产的科学管理体系具有一定的参考价值。
水稻 优化光谱指数 高光谱 BP神经网络 Rice SPAD Optimized spectral index Hyperspectral BP neural network SPAD 
光谱学与光谱分析
2022, 42(4): 1092
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
小麦是我国的主要粮食作物, 在国民经济发展中具有举足轻重的地位。 然而, 盐与物理损伤等非生物胁迫, 逐渐成为制约小麦产量和品质的重要因素。 研究表明, 细胞壁是植物细胞直接抵御逆境胁迫的重要防线。 盐胁迫下, 细胞渗透压增大, 质膜的透性会受到一定程度的影响。 为了维持细胞的形态和结构, 植物细胞壁中的果胶等多糖物质会发生不同程度的转化和改变。 物理损伤, 会加深植物细胞膜脂过氧化的程度, 使膜通透性增大, 导致营养物质的流失和降解。 受到损伤的部位及其周边细胞还会发生栓化以阻塞病菌的侵入。 构成植物细胞壁主要成分且能够反映细胞壁以及膜系统完整性和透过性的果胶, 可以作为研究胁迫下植物内部物质响应规律的重要指标。 目前, 质量法、 比色法、 液相色谱法等常用的果胶检测方法操作繁琐、 实时性不强且对样本损耗较大。 亟需一种操作简便、 检测速度快、 无损的检测方法。 将烟农0428小麦作为研究对象, 采用水培方式, 以向培养液中施加氯化钠(NaCl)溶液和对小麦第一片叶主脉两侧针刺分别模拟盐胁迫和昆虫叮咬造成的物理损伤, 并完成小麦叶片果胶及高光谱信息的采集与处理。 利用相关分析法筛选光谱敏感波段, 将主成分回归(PCR)、 偏最小二乘法(PLS)、 逐步多元线性回归(SMLR)三种建模方法分别与多元散射校正(MSC)、 标准正态变换(SNV)、 一阶导数(FD)、 卷积平滑(S-G)、 Norris导数滤波(NDF)等预处理技术相结合, 建立果胶含量反演模型。 最终, 选定PLS+SNV+FD+NDF方法建立的模型为最优模型, 并对其性能进行了测试。 结果表明: 果胶含量的预测值与实测值一致性较高, 拟合系数(R2)和均方根误差(RMSE)分别为0.997 6和0.35; 预测值重复性较好, 相对标准偏差(RSD)为1.2%。 该研究以新方法实现小麦果胶的高精度、 快速、 无损检测, 有助于小麦响应逆境胁迫机理的深入探索, 并为大田作物胁迫程度预测及种植环境的精准管控提供参考。
小麦 高光谱技术 果胶 盐胁迫 物理损伤 模型预测 Wheat Hyperspectral technique Pectin Salt stress Physical damage Model prediction 
光谱学与光谱分析
2022, 42(9): 2935
作者单位
摘要
1 吉林农业大学 信息技术学院,吉林长春308
2 吉林农业大学 工程技术学院,吉林长春130118
3 吉林大学 工程仿生教育部重点实验室,吉林长春10025
为了适应保护性耕作秸秆还田监测的技术需求,提出了一种改进的U-Net语义分割算法对秸秆覆盖率进行检测。首先,提出一种新的卷积模块代替原始U-Net框架中的卷积模块;其次,改进Inception结构,引入条纹池化和高效空间金字塔空洞卷积模块,形成新的Gception结构;最后,在模块中引入注意力机制。利用无人机采集田间地表图像,将改进的U-Net模型应用于自标注田间秸秆图像分割,与U-Net,PSP-Net,Link-Net,Res-Net,DSRA-Unet和DE-GWO算法进行对比实验,得到的平均交并比为80.05%,平均像素精确度为91.20%,覆盖率平均误差为0.80%。实验结果表明,改进U-Net模型的分割结果优于对比算法,能够保证特征提取的有效性和全局特征的完备性,有效剔除树影以及田内其他干扰因素。该模型适用于含有农机和树影等干扰的田间复杂场景,在大尺度图像中亦可获得较好的分割效果,可为大面积秸秆覆盖率检测提供技术支持。
秸秆图像 覆盖率检测 语义分割 U-Net模型 注意力机制 straw image coverage detection semantic segmentation U-net model attention mechanism 
光学 精密工程
2022, 30(9): 1101
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
光温环境胁迫是影响作物优质高产的一个主要制约因素, 传统的作物胁迫监测, 敏锐性不足、 耗时费力且多为有损检测。 近年来随着信息技术的快速发展, 高光谱技术能够快速无损的获取作物生理信息, 并对逆境胁迫响应进行动态监测, 为现代农业的精准化生产和智能化决策提供了数字化支撑, 对实现传统农业向精准化、 数字化的现代农业转变具有重要意义。 以玉米苗期为研究对象, 获取不同光温环境下叶片的高光谱数据和生理参数, 探究玉米苗期叶片对不同光温环境的响应规律, 进行高光谱差异性分析, 并构建生理参数的高光谱反演模型。 利用相关分析法筛选光谱敏感波段, 采用多元散射校正(MSC)、 标准正态变量变换(SNV)、 Savitzky-Golaay(S-G)平滑相结合的预处理方法, 分别与偏最小二乘回归法(PLS)、 主成分回归法(PCR)、 逐步多元线性回归法(SMLR)三种建模方法组合, 以模型相关系数和均方根误差作为模型效果评价指标, 探索高光谱反演叶片生理参数模型的最优方法。 结果表明: 不同光温环境下玉米的高光谱特性在整体上变化趋势一致, 但仍存在差异, 在500~700 nm波段内, 光谱反射率的升高表明光强的增强; 在760~900 nm波段内, 光谱反射率的升高表明温度的增强; 且光温胁迫环境的变化, 均可反映在高光谱特性上, 波段760~900 nm内光谱的反射率在高温胁迫环境下较高, 在弱光胁迫环境下较低, 在低温胁迫环境下反射率显著降低; 所构建的SPAD和Fv/Fm的反演模型中, 建模最优方法为PLS-MSC-SG, 模型验证集相关系数分别为0.958和0.976, 训练集相关系数分别为0.979和0.995。 模型的预测性精度较高, 表明利用高光谱技术, 可以实现光温环境胁迫下玉米植株的定量监测, 提高田间精细化管理水平, 为玉米优质高产的智能化管理提供参考依据。
玉米苗期 光温耦合 高光谱数据 环境胁迫 Corn seedling Light-temperature coupling Hyperspectral data Environmental stress 
光谱学与光谱分析
2021, 41(11): 3545
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
叶绿素含量的准确获取及预测可为作物种植的精准化管理提供理论依据。 利用最优光谱指数建立大豆叶绿素含量反演模型, 以大豆花芽分化期叶片为研究对象, 获取高光谱和叶绿素含量数据。 首先构建了7种与叶绿素含量相关的典型光谱指数, 分别为比值指数(RI)、 差值指数(DI)、 归一化差值植被指数(NDVI)、 修正简单比值指数(mSR)、 修正归一化差值指数(mNDI)、 土壤调节植被指数(SAVI)和三角形植被指数(TVI), 并对原始高光谱进行一阶微分(FD)处理, 随后分别对原始和一阶微分高光谱在全光谱波长范围内两两组合所有波长, 进行14个光谱指数的计算。 再采用相关矩阵法进行最优光谱指数的提取, 将所有波长组合计算出的光谱指数与叶绿素含量进行相关性分析, 以相关系数最大值为指标, 提取出14组最优的波长组合, 并进行对应光谱指数值的计算作为最优光谱指数。 最后将最优光谱指数划分为3组模型输入变量, 分别与偏最小二乘回归(PLS)、 最小二乘支持向量机回归(LSSVM)和套索算法LASSO回归3种方法组合建模并对比分析, 以决定系数R2c, R2p和均方根误差RMSEC, RMSEP作为模型评价指标, 最终优选出精度最高的大豆叶片绿素含量反演模型。 结果表明: 14组最优光谱指数波长组合分别为RI(728, 727), DI(735, 732), NDVI(728, 727), mSR(728, 727), mNDI(728, 727), SAVI(728, 727), TVI(1 007, 708), FDRI(727, 708), FDDI(727, 788), FDNDVI(726, 705), FDmSR(726, 705), FDmNDI(726, 705), FDSAVI(727, 788)和FDTVI(760, 698), 相关系数最大值rmax均大于0.8。 建立最优模型的方法为输入变量为一阶微分光谱指数(组合2)与LSSVM组合的建模方法, 所建模型的R2c=0.751 8, R2p=0.836 0, RMSEC=1.361 2, RMSEP=1.220 4, 表明模型精度较高, 可为大面积监测大豆的生长状态提供参考。
大豆 最优光谱指数 叶绿素含量 反演模型 Soybean Optimal spectral index Chlorophyll content Inversion model 
光谱学与光谱分析
2021, 41(6): 1912
作者单位
摘要
吉林大学生物与农业工程学院, 吉林 长春 130022
大气中的颗粒物不仅影响人类生活, 还影响植物的光合作用、 生长发育和产量品质。 实现了颗粒物污染环境的人工模拟, 并对采收期的小白菜、 生菜、 小油菜三种叶菜进行颗粒物作用试验, 获取叶片的光合生理信息和高光谱数据, 基于高光谱技术和植物表型分析叶菜对颗粒物的响应机理, 研究叶菜的光合特性和光谱特征对颗粒物污染的响应情况。 结果表明: 以颗粒物作为唯一差别条件下, 三种叶菜叶片的高光谱曲线整体趋势相同, 在可见光波段内试验组反射率增加最大, 红边位置发生蓝移, 小油菜对颗粒物的作用最敏感, 小白菜吸附颗粒物的能力最强。 分别比较三种叶菜的净光合速率与叶片原始光谱、 一阶导数光谱的相关性, 利用相关分析法提取三种叶菜的敏感波段, 用原始光谱、 FD、 MSC和相关分析法提取特征波长; 比较10个高光谱特征参数及4个植被指数与净光合速率的相关系数, 选出敏感光谱特征参数和植被指数, 即生菜的Dr, SDr, SDr/SDb和SDr/Sdy, 小白菜的SDr, Dy, NIRRP, (SDr-SDy)/(SDr+SDy)以及小油菜的λr, SDy, (SDr-SDy)/(SDr+SDy)。 用ln对数运算、 多项式函数以及几种组合方法建立三种叶菜叶片的净光合速率定量反演模型, 其中, 预处理方法采用SG, FD, SD和MSC, 建模方法采用CLS, PLS, PCR和SMLR。 以相关系数为模型评价指标, 最终确定FD+SG+PLS方法是建立生菜和小白菜净光合速率反演模型的最优方法, FD+SG+MSC+SMLR方法是建立小油菜净光合速率反演模型的最优方法。 所建模型可为今后颗粒物污染环境下的模型修正提供参考, 具有实用性。 研究结果为利用高光谱技术研究叶菜类蔬菜在颗粒物污染环境下的诊断与分析提供理论依据, 为设施农业蔬菜的病害预警、 生理信息监测、 设施环境的净化和管控提供新思路。
颗粒物 高光谱 叶菜 净光合速率 反演模型 Particle matters Hyperspectral Leaf vegetable PM2.5 Net photosynthetic rate Inversion model PM2.5 
光谱学与光谱分析
2021, 41(1): 236

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