作者单位
摘要
中国医学科学院生物医学工程研究所, 天津 300192
非侵入性激光照射可以诱导细胞和组织的光生物调节效应。光生物调节(PBM)应用广泛, 特别是在抗微生物感染和改善炎症方面有着很好的效果。然而, 研究发现, PBM对细菌和炎症有双向调节现象, 抗菌-促菌和抑炎-促炎在不同的试验条件下会发生变化。近些年来, PBM的临床应用受到越来越多的关注, 特别是在抗菌领域, 因为它是一种无创的策略, 禁忌症少。然而, 由于双向调节效应, 研究人员仍然对PBM的应用方式存疑, 必须根据其临床应用进行光照波长、剂量等参数的修改。因此, 本文总结了PBM对细菌的双向调节效应, 分析了这种双向调节效应产生的影响因素及其分子机制。PBM对细菌的双向调节作用受光照波长、剂量、细菌类别及细菌状态的影响。更好地了解低强度激光治疗中双向剂量反应的程度能够探索PBM使用的最可靠机制, 并最终使各种疾病患者的治疗标准化, 这对于优化临床治疗是必要的。此外, 研究人员对PBM双向调节机制的合理利用使其可以达到促进或抑制细菌生长的作用, 这在微生物制造、菌群调节、改善和治疗疾病等领域有广阔的应用前景。
光生物调节 双向调节 分子机制 肠道菌群 抗菌-促菌 photobiomodulation bidirectional regulatory molecular mechanism intestinal flora antibacterial-promoting bacteria 
激光生物学报
2023, 32(5): 0393
作者单位
摘要
1 天津中医药大学中药制药工程学院, 天津 301617
2 天津中医药大学中药制药工程学院, 天津 301617 省部共建组分中药国家重点实验室, 天津 301617
3 扬子江药业集团江苏龙凤堂中药有限公司, 江苏 泰州 225321
水、 空气、 食品、 灰尘和排泄物中广泛存在食源性病原菌, 由此引发的感染性疾病严重危害人类健康。 因此, 开发病原菌的快速检测方法尤为必要。 由于实际样品中的病原菌往往共生存在, 所以多元病原菌的同步灵敏检测是微生物检测领域的重点与难点。 分子生物学和免疫组化分析技术都在此领域进行过一些尝试, 但由于引物设计与抗体的局限性, 这两种技术在实际应用中的效果并不十分理想。 表面增强拉曼光谱(SERS)技术由于具有快速、 无损、 高分辨率、 不受水分干扰、 可原位检测等显著优势, 在多元病原菌同步检测领域获得了重要应用。 从应用原理、 特点和效果等方面出发, 系统阐述了SERS技术在多元病原菌同时检测中的应用策略。 首先对SERS基底材料与病原菌的结合方式进行简要概述, 再以检测策略为主线, 从直接法和间接法两种策略出发进行介绍。 直接法通过基底材料的信号放大作用直接获得病原菌本身的光谱信息, 步骤简便, 操作快捷, 在多元病原菌判别分析、 定量分析与即时检测(POCT)中被广泛应用。 但由于光谱信息量大, 往往需要与多元统计分析方法、 成像技术和微流控器件等联用。 间接法一般需要借助拉曼信号分子和适配体、 抗体等识别元件, 将对病原菌的检测转换为对信号分子的分析, 极大提高了检测方法的灵敏度与特异性, 可在基因、 蛋白、 细胞等水平实现对多元病原菌的同步分析。 且与其他识别元件及功能分子的联用能构建得到集细菌的分离、 识别与灭活于一体的综合检测体系, 在临床血液等实际样本的分析中具有重要前景。 最后, 总结并指出SERS技术的现有问题及下一步努力方向, 为SERS技术在多元病原菌的快速、 灵敏检测策略设计及具体应用方面提供参考。
表面增强拉曼光谱(SERS) 多元病原菌 鉴别分析 定量分析 Surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) Multiple pathogenic bacteria Identification analysis Quantitative analysis 
光谱学与光谱分析
2023, 43(7): 2012
郑家运 1,2王贻坤 2,3倪敬书 2张洋 2[ ... ]董美丽 2,***
作者单位
摘要
1 安徽医科大学 生物医学工程学院,合肥 230032
2 中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所 安徽省生物医学光学仪器工程技术研究中心,安徽省医用光学诊疗技术与装备工程实验室,合肥 230031
3 皖江新兴产业技术发展中心,铜陵 244000
细菌感染会造成伤口愈合延迟,增加患者和医疗卫生系统的负担,因此非常需要对伤口细菌进行及时检测和适当的处理。基于细菌自发荧光原理,设计了一种对伤口常见细菌快速检测成像的系统,可用于辅助识别伤口细菌负荷和判断感染情况,无需采样培养或染色鉴定。使用智能手机采集细菌荧光图像,以405 nm LED作为细菌激发光源,配合荧光图像信息提取和定量算法能够快速识别提取图像上的感兴趣区域并对荧光信号进行量化,定位细菌荧光信号区域。梯度浓度实验证实了荧光强度与细菌浓度高度相关,荧光强度与浓度之间存在线性关系,随着细菌浓度的降低,荧光信号强度呈下降趋势,系统最小检测限约为105 CFU/mL。与传统细菌检测方法相比,本装置具有操作简单、检测速度快、成本低等特点,为伤口细菌检测提供了一种新的手段。
细菌自体荧光成像 细菌检测 感染 图像处理 细菌量化 Bacterial autofluorescence imaging Bacteria detection Infection Image processing Bacterial quantization 
光子学报
2023, 52(6): 0617001
张云秀 1,2贾庆岩 1,3,**葛介超 1,2,*
作者单位
摘要
1 中国科学院理化技术研究所 光化学转换与功能材料重点实验室,北京 100190
2 中国科学院大学 未来技术学院,北京 100049
3 西北工业大学 柔性电子前沿科学中心,陕西 西安 710129
随着细菌耐药性的不断播散,尤其是“超级细菌”的出现,临床可用抗生素药物越来越少,迫切需要发展新的高效、低毒和无耐药性的抗菌材料和技术。本研究采用生物质绿茶作为碳源,通过溶剂热法,成功制备了具有光动力治疗(Photodynamic therapy,PDT)性能的绿茶衍生碳点(T-CDs)。在660 nm激光照射下,所制备的T-CDs 能够有效产生活性氧。细胞和活体实验表明,T-CDs具有优异的生物相容性,且产生的活性氧能杀死耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,从而通过降低细菌引起的伤口炎症,加速伤口愈合。本研究所制备的T-CDs能够通过PDT杀灭致病菌,促进感染伤口愈合,为开发抗生素替代药物提供了新的思路,同时对探索耐药菌感染伤口临床治疗新方案具有重要参考价值。
碳点 光动力治疗 耐药菌感染 生物质 carbon dots photodynamic therapy drug-resistant bacteria biomass 
发光学报
2023, 44(6): 1112
杨勇 1,2董浩 1,2桑瑶烁 1,2李志刚 1,2[ ... ]王澍 1,2,*
作者单位
摘要
1 中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所,安徽 合肥 230031
2 中国科学技术大学研究生院科学岛分院,安徽 合肥 230031
细菌拉曼光谱信号弱、相似度高且易被噪声干扰,使用传统机器学习方法对其分类时必须进行繁杂的光谱预处理,效率低下。为提高细菌拉曼光谱分类的准确率和效率,提出了一种基于密集连接的一维卷积神经网络模型Raman-net,无需额外的光谱预处理就能有效完成光谱分类。实验结果表明,Raman-net对Bacteria-ID公开数据集中30种细菌低信噪比拉曼光谱的分类准确率为84.26%,显著高于传统机器学习方法及对比方法。对于碳青霉烯类抗生素敏感和耐药的2种肺炎克雷伯菌表面增强拉曼光谱,Raman-net取得了99.16%的分类准确率。这表明对于细菌的普通拉曼光谱和表面增强拉曼光谱,Raman-net无需光谱预处理就能取得较好的分类效果,为致病菌的拉曼光谱鉴定提供了一种快速有效的方法。
光谱学 拉曼光谱 光谱鉴别 机器学习 致病菌 
激光与光电子学进展
2023, 60(1): 0130003
作者单位
摘要
1 湖南省烟草公司郴州市公司,郴州 423000
2 中南大学资源加工与生物工程学院,长沙 410083
3 湖南省烟草公司永州市公司,永州 425000
植物根际微生物与植物生长密切相关,但根际微生物群落如何影响根系的发育情况仍研究甚少。本研究利用16S rRNA基因高通量测序技术检测了烟草的根际细菌群落,并探究了烟草根系不同发育情况与根际微生物群落差异的关联机制。结果表明: 相比不发达根系(UDR),发达根系(WDR)的根际细菌物种的丰度和多样性均较高,Gallionella和Luteimona等属的丰度显著增加,而Edaphobaculum、PLTA13和Rhodobacter等属的丰度则显著降低(P<0.05); UDR的分子生态网络更加复杂,且物种间相互作用强,特别是合作行为,而WDR的网络关键节点数较多,其碳循环相关网络模块数与UDR相比增加; 此外,WDR的根际细菌群落装配更趋向于发育聚集,且环境过滤在其中发挥了更重要的作用。总体上,本研究结果强调了根际微生物群落的结构组成、网络变化和群落装配在植物根系的生长过程中的重要作用,为植物根际微生物生态学研究提供了理论依据。
根际细菌 群落结构 发育装配 烟草 根系生长性状 rhizosphere bacteria community structure developmental assembly tobacco root growth traits 
激光生物学报
2022, 31(6): 542
作者单位
摘要
1 湖南师范大学医学院, 长沙 410013
2 长沙市第九医院检验科, 长沙 410004
3 中南大学湘雅三医院, 长沙 410013
研究慢阻肺合并肺部感染患者的病原菌分布及药敏情况, 以期为临床抗生素的正确使用提供依据。从长沙某医院2017年3月—2022年2月慢阻肺合并肺部感染患者痰培养标本检出的病原菌中随机筛选了1?500株进行培养鉴定及药敏试验, 统计并分析病原菌的分布情况以及检出的主要革兰氏阴性菌(肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌)的耐药特点及趋势。结果发现: 1 500株病原菌中共检出革兰氏阴性菌1 251株(83.40%), 其中比例居前的分别是肺炎克雷伯菌384株(25.60%)、铜绿假单胞菌333株(22.20%)和鲍曼不动杆菌303株(20.20%); 革兰氏阳性菌126株(8.40%), 其中比例居前的分别是金黄色葡萄球菌69株(4.60%)、肺炎链球菌27株(1.80%); 真菌123株(8.20%), 主要为白色念珠菌96株(6.40%)。药敏分析结果显示: 肺炎克雷伯菌对庆大霉素、左氧氟沙星、头孢他啶及氨曲南的耐药率变化具有统计学意义(P<0.05); 铜绿假单胞菌对于氨曲南的耐药趋势具有统计学意义(P<0.05); 鲍曼不动杆菌对于大多数抗菌药物均具有较高的耐药率, 且对于左氧氟沙星、复方新诺明、美罗培南的耐药趋势具有统计学意义(P<0.05)。抗感染是治疗慢阻肺的一个重要措施, 及时正确的选择敏感抗生素是关键环节。本研究为临床精准选择合适的抗菌药物治疗慢阻肺提供了帮助, 同时有助于了解本地区细菌耐药的发展趋势, 具有重要的临床价值和意义。
慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺) 肺部感染 病原菌分布 药物敏感性 细菌耐药 chronic obstructive pulmonary disease (COPD) pulmonary infection distribution of pathogenic bacteria drug sensitivity bacterial resistance 
激光生物学报
2022, 31(5): 433
作者单位
摘要
河南农业大学食品科学技术学院, 河南 郑州 450000
为了探究食源性致病菌芽孢的拉曼特征指纹图谱, 实现快速识别, 该研究以产气荚膜梭菌(C. perfringens)、 艰难梭菌(C. difficile)和蜡样芽孢杆菌(B. cereus)的芽孢为研究对象, 以柠檬酸钠还原法制备的AgNPs溶胶为基底材料, 用SERS技术对芽孢进行拉曼光谱检测, 解析食源性致病菌芽孢的分子结构、 不同芽孢之间的异同之处。 将3种食源性致病菌芽孢的SERS光谱与主成分分析(PCA)和系统聚类分析(HCA)相结合并进行对比分析, 实现不同种属食源性致病菌芽孢的定性识别。 结果表明, 不同食源性致病菌芽孢的SERS光谱的特异性和重现性良好。 芽孢光谱中Ca2+-DPA的拉曼振动峰数量和峰强度占主要地位, 其拉曼振动峰位置在657~663, 818~820, 1 017, 1 389~1 393, 1 441~1 449和1 572~1 576 cm-1波段。 C. difficile spores SERS光谱中Ca2+-DPA的六个特征峰峰强度均高于C. perfringens sporesB. cereus spores, C. perfringens spores次之。 Ca2+-DPA在1 017 cm-1(Ca2+-DPA)处拉曼峰强度在3种芽孢的SERS光谱中均最高且差异明显, 是Ca2+-DPA的主要特征峰, 也是3种芽孢的主要特征峰。 此外, C. perfringens spores在936 cm-1(磷脂N—C拉伸)、 1 294 cm-1(脂质中的CH2变形振动)、 1 609 cm-1(蛋白质中的酪氨酸)和1 649 cm-1(蛋白质中的酰胺I)显示特有拉曼振动峰; C. difficile spores在890 cm-1(=C—O—C=拉伸)显示特有拉曼振动峰。 PCA分析结果显示PC1和PC2方差贡献率分别为51.1%和39.7%, 累积贡献率达90.8%, 可以将所有样本有效区分。 HCA分析可以看出3种芽孢的SERS光谱被分为三个聚类, 3种芽孢各自聚类无交叉干扰。 结合多元统计分析不仅有效实现了3种芽孢之间的区分, 也实现了梭菌属芽孢和杆菌属芽孢的区分, 为食品安全控制提供有效手段。
食源性致病菌芽孢 表面增强拉曼光谱 光谱解析 快速识别 Food-borne pathogenic bacteria spores SERS AgNPs Spectral analysis Rapid identification AgNPs 
光谱学与光谱分析
2022, 42(9): 2774
作者单位
摘要
1 广东医科大学生物医学工程学院生物医学光子学实验室, 广东 东莞 523808
2 广东省分子诊断重点实验室, 广东 东莞 523808
随着抗菌药物广泛应用于临床, 细菌耐药日益严重。 实现快速、 高灵敏、 准确的细菌及其药物敏感性检测是缓解细菌耐药的关键环节。 表面增强拉曼光谱(SERS)具有快速、 灵敏、 无损等优点, 可直接获取分子指纹信息, 它已成为一种有效的细菌及其耐药性检测技术。 不同种类细菌的分子组成和结构存在差异、 抗生素处理前后细菌的特征拉曼信号会发生变化, 这为表面增强拉曼光谱技术在致病菌及其耐药性检测中的应用提供了依据。 基于分子组成与结构的差异, 结合传统多分类数据分析以及机器学习算法, 表面增强拉曼光谱技术可以提供客观的诊断信息。 这篇综述回顾了近年来表面增强拉曼光谱技术对于致病菌及其耐药性检测的研究进展, 阐述了当前表面增强拉曼光谱技术应用于致病菌检测面临的问题。 首先, 讨论了致病菌及其耐药性检测中常用SERS基底的材料和结构: 金纳米粒子、 银纳米粒子、 银包金纳米粒子以及新型纳米材料与纳米粒子结合形成的复合SERS基底。 然后, 概述了SERS检测中捕获细菌的方法, 主要介绍了基于核酸适配体、 免疫磁性分离、 微流控系统以及静电结合的捕获方法, 包括上述捕获方法的原理以及捕获方式, 综述了以上捕获方法的研究进展。 最后, 总结了致病菌SERS光谱的各种数据分析方法, 通过光谱预处理, 特征提取与分类识别, 以及构建致病菌SERS光谱诊断模型, 实现致病菌及其耐药性的检测; 比较了传统的数据分析方法以及机器学习分析方法, 重点介绍了深度学习算法在致病菌及其耐药性SERS检测中的优势与应用。 文章也对表面增强拉曼光谱应用于致病菌及其耐药性检测的关键问题进行了讨论, 并对基于表面增强拉曼技术的致病菌及其耐药性检测方法进行了展望, 以促进表面增强拉曼光谱技术在临床检测中的应用。
表面增强拉曼光谱 致病菌 耐药性 Surface enhanced Raman spectroscopy Pathogenic bacteria Drug resistance 
光谱学与光谱分析
2022, 42(5): 1339
李世芳 1,2何红 1,3葛闯 4,*陈李 1,3徐溢 1,3,*
作者单位
摘要
1 重庆大学 新型微纳器件与系统技术重点学科实验室&光电技术与 系统教育部重点实验室,重庆400044
2 重庆大学 化学化工学院,重庆400044
3 重庆大学 光电工程学院,重庆400044
4 重庆大学肿瘤医院 癌症转移与个体化治疗转化研究重点实验室,重庆00030
针对致病菌快速高效的辨识和检测一直是生命科学、医疗诊断、食品安全和环境监测等领域备受关注的热点。微流控芯片分析技术为细菌等微生物的研究和检测提供了新的、高效的途径和平台,将表面增强拉曼散射(Surface Enhanced Raman Scattering, SERS)光谱检测技术与其结合,成为了具有突出优势的致病菌快速鉴别和检测途径。本文针对基于微流控芯片的SERS分析技术及其应用进行综述,首先对各种SERS增强基底材料进行了介绍和性能比较;然后,系统综述了在微流控芯片上集成SERS基底的方法和技术,分别探讨了在微流控通道中注入纳米金属溶胶的外部注入法,在微流控芯片检测区构建固体纳米结构的内嵌法和在微流控通道中原位制备纳米结构基底的原位制作法;最后,对集成SERS检测技术的微流控芯片分析方法在致病菌定性鉴别和定量检测方面的应用进展予以了综述和展望。
表面增强拉曼散射 纳米增强基底 微流控芯片 致病菌检测 surface enhanced raman scattering (SERS) nano-reinforced substrate microfluidic chip detection of pathogenic bacteria 
光学 精密工程
2022, 30(14): 1643

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