针对致病菌快速高效的辨识和检测一直是生命科学、医疗诊断、食品安全和环境监测等领域备受关注的热点。微流控芯片分析技术为细菌等微生物的研究和检测提供了新的、高效的途径和平台，将表面增强拉曼散射（Surface Enhanced Raman Scattering， SERS）光谱检测技术与其结合，成为了具有突出优势的致病菌快速鉴别和检测途径。本文针对基于微流控芯片的SERS分析技术及其应用进行综述，首先对各种SERS增强基底材料进行了介绍和性能比较；然后，系统综述了在微流控芯片上集成SERS基底的方法和技术，分别探讨了在微流控通道中注入纳米金属溶胶的外部注入法，在微流控芯片检测区构建固体纳米结构的内嵌法和在微流控通道中原位制备纳米结构基底的原位制作法；最后，对集成SERS检测技术的微流控芯片分析方法在致病菌定性鉴别和定量检测方面的应用进展予以了综述和展望。