作者单位
摘要
1 西安工业大学光电工程学院 西安 710021
2 陕西科技大学食品与生物工程学院 西安 710021
3 中国北方车辆研究所 北京 100072
为了探究低能N+注入对大肠杆菌16S rRNA遗传进化与耐药表征的作用,本研究利用低能N+注入诱变筛选耐药大肠杆菌,通过基因组de novo测序获得其16S rRNA基因序列,通过K-B法检测诱变菌株的耐药特征。结果共诱变获得了25株耐药菌株,其中5株诱变菌16S rRNA基因分别出现片段缺失,点突变(A257C),GC%含量增高,二级结构变异,并获得多药耐药特性。结果提示:低能N+注入可以驱动大肠杆菌16S rRNA基因的随机突变和进化,进而调节耐药基因从头合成或变异,使大肠杆菌耐药性改变。
低能N+注入 大肠杆菌 16SrRNA 耐药性 Low-energy N+ ion implantation Escherichia coli 16S rRNA Antibiotic resistance simulation 
辐射研究与辐射工艺学报
2024, 42(1): 010301
作者单位
摘要
1 湖南师范大学医学院, 湖南 长沙 410013
2 湖南农业大学生物技术学院, 湖南 长沙 410128
3 长沙商务旅游职业技术学院, 湖南 长沙 410008
为分析不同饲料喂养对黄牛胃中微生物群落结构的影响, 分别用芒草单一喂养和农家混合饲料喂养两年的黄牛为实验组和对照组。以瘤胃、蜂巢胃、重瓣胃和皱胃四个胃中的微生物为研究对象,采用原位包埋裂解法和脉冲场电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)提取微生物总DNA, 脉冲场电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)。使用细菌16S rRNA引物341F/534R及真菌18S rDNA引物NS1/GCFungi进行降落PCR扩增。变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)对扩增产物进行区分,使用硝酸银染色。电泳扫描结果通过Quantity one软件进行分析, SPSS软件进行数据统计。针对实验组和对照组瘤胃样品共性条带和特性条带测序并比对。结果表明: 实验组与对照组细菌群落结构变化较大, UPGAM聚类图上被分为两支, 相似性只有0.35。且香农多样性指数及条带丰度都明显少于对照组。真菌DGGE图谱条带差别不大, 聚类图上显示实验组四个样品与对照组四个样品相似性在0.43~0.68之间。多样性及条带丰度在实验组与对照组之间差异0.0027~0.5999。测序结果, 细菌与数据库中未培养细菌种类较为接近, 而真菌中部分与已知菌种接近。芒草单一饲养对牛胃中的微生物群落结构具有极大的影响, 对细菌的影响尤为明显。
微生物群落结构 Microbial community structure PCR-DGGE PCR-DGGE PFGE PFGE 16S rRNA 16S rRNA 18S rDNA 18S rDNA 
激光生物学报
2016, 25(4): 362
作者单位
摘要
1 福建师范大学,生命科学学院,福建 福州 350107
2 福州市环境监测站, 福建 福州 350011
3 中国科学院水生生物研究所,湖北 武汉 430072
首次从福州市一重要供水水库中分离到一株体型微小的丝状蓝藻,该藻喜粘附在微囊藻胶被内外。为了确定该蓝藻的种类和分类学地位,通过形态特征分析和16S rRNA 序列分析的方法鉴定其种类,并利用激光共聚焦扫描显微镜的荧光光谱以及色素提取物的吸收光谱分析其色素组成。结果表明,该藻株为粘伪鱼腥藻(Pseudanabaena mucicola)(GenBank序列登录号为KR912197),黏伪鱼腥藻不仅含有藻蓝蛋白,同时也含藻红蛋白。此结果为该藻株分类位置的确定提供了有利佐证。
伪鱼腥藻 分离鉴定 激光共聚焦扫描术 Pseudanabaena isolation and identification 16S rRNA 16S rRNA LSCM 
激光生物学报
2015, 24(5): 410
作者单位
摘要
1 淮南师范学院生命科学系, 安徽 淮南 232001
2 安徽科技工程学院生物化学工程系, 安徽 芜湖 241000
利用多对引物, 扩增并测定出大黄鱼16S rRNA基因和18S rRNA基因的部分序列, 其长度分别为1 202 bp和1 275 bp, 16S rRNA基因序列的GC含量为46.12 %, 18S rRNA基因的GC含量为53.00 %。将大黄鱼16S rRNA基因序列与GenBank中15种硬骨鱼类的同源序列结合, 同时将其18S rRNA基因序列与GenBank中9种脊索动物的同源序列相结合, 运用软件获得各自序列间差异百分比, 转换和颠换数值等信息。基于这两种基因序列, 利用NJ法和BI法, 分别构建16种硬骨鱼类和10种脊索动物的分子系统树。18S rRNA构建的系统树包括三大支, 一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种, 一支为两栖类的1个物种, 另一支为2种硬骨鱼类。16S rRNA构建的系统树显示大黄鱼所在的石首鱼科与鲈科和盖刺鱼科亲缘关系较近。此外还讨论了这两个基因的序列特征。
大黄鱼 16S rRNA 基因 18S rRNA 基因 序列分析 Larimichthys crocea 16S rRNA gene 18S rRNA gene sequence analysis 
激光生物学报
2010, 19(4): 458

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