1 湖南科技大学生命科学学院, 湖南 湘潭410201
2 中南大学资源加工与生物工程学院, 湖南 长沙410083
根据GenBank 和ICB 数据库中gyrB蛋白氨基酸序列的两个保守区域TPGMYIG和QRY(F)KGLGEM设计简并引物, 以L. ferriphilum菌株YSK基因组DNA为模板, PCR扩增出获得大小约为2.2 kb的DNA片段。序列分析表明, 菌株YSK的扩增片断的开放阅读框(ORF)能够推导出一个编码分子量约为82.24 kD、氨基酸数目为731个的蛋白质片断。这个氨基酸序列与所研究的gyrB蛋白氨基酸序列显示出高度的同源性, 尤其是与菌株AMC_Cont91的gyrB蛋白氨基酸序列的相似性高达92 %, 而与M. xanthus的gyrB的相似性最低, 仅为37 %。基于氨基酸序列的同源性及其所预测的蛋白质大小, 可以推断出该扩增片段属于gyrB基因。
嗜铁钩端螺旋菌 gyrB 基因 序列分析 保守区 L. ferriphilum gyrB gene sequence analysis conserved regions