Author Affiliations
Abstract
1 Peking University, National Engineering Research Center of Visual Technology, Beijing, China
2 Hangzhou Dianzi University, School of Automation, Hangzhou, China
3 Medical School of Nanjing University, Nanjing, China
4 Hangzhou Dianzi University, School of Communication Engineering, Hangzhou, China
5 Lishui Institute of Hangzhou Dianzi University, Lishui, China
Light-field fluorescence microscopy (LFM) is a powerful elegant compact method for long-term high-speed imaging of complex biological systems, such as neuron activities and rapid movements of organelles. LFM experiments typically generate terabytes of image data and require a substantial amount of storage space. Some lossy compression algorithms have been proposed recently with good compression performance. However, since the specimen usually only tolerates low-power density illumination for long-term imaging with low phototoxicity, the image signal-to-noise ratio (SNR) is relatively low, which will cause the loss of some efficient position or intensity information using such lossy compression algorithms. Here, we propose a phase-space continuity-enhanced bzip2 (PC-bzip2) lossless compression method for LFM data as a high-efficiency and open-source tool that combines graphics processing unit-based fast entropy judgment and multicore-CPU-based high-speed lossless compression. Our proposed method achieves almost 10% compression ratio improvement while keeping the capability of high-speed compression, compared with the original bzip2. We evaluated our method on fluorescence beads data and fluorescence staining cells data with different SNRs. Moreover, by introducing temporal continuity, our method shows the superior compression ratio on time series data of zebrafish blood vessels.
light-field microscopy lossless compression phase space entropy judgment 
Advanced Photonics Nexus
2024, 3(3): 036005
作者单位
摘要
1 上海科技大学 物质科学与技术学院,上海 201210
2 清华大学 工程物理系,北京 100084
理论上,使用断层扫描技术可以得到真实的横向相空间分布。但是想要更加精确地了解分布的细节,需要解决旋转角度范围受限和投影数目不足的问题。针对这两个问题,提出了在混合域处理的神经网络模型,即组合地在正弦域和断层域分别使用插值和去除伪影神经网络。在简单地测量束线以及投影数目比较少(7个)的情况下,该网络模型也能高质量地重建束团横向相空间分布。并且,由于选择旋转角度的方式和归一化相空间无关,因此,无需测量Twiss参数。采用该方法测量束团横向相空间,一定程度提升了重建质量,简化了测量的方式。
横向相空间 断层扫描 机器学习 神经网络 transverse phase space computerized tomography machine learning neural network 
强激光与粒子束
2023, 35(11): 114005
龚有为 1,2程文才 1,2赵明华 1李烜 3[ ... ]张猛 3,*
作者单位
摘要
1 中国科学院 上海应用物理研究所,上海 201800
2 中国科学院大学,北京 100049
3 中国科学院 上海高等研究院,上海 201210
X射线自由电子激光器(FEL)由于其超高亮度、超短脉冲等特点,在世界范围内得到广泛应用。 基于尾流场理论,我们计算了上海X射线自由电子激光器(SXFEL)中从直线加速器出口到波荡器末端,束流在245 m不锈钢传输线和波荡器中的阻抗壁尾场。通过对两种不同的阻抗壁尾场的叠加,发现将导致束流纵向相空间的畸变。在SXFEL上进行束流物理的实验,并得到与理论预测非常吻合的实验结果。 结合之前对主要直线加速器部分的详细模拟和实验研究,为后续FEL整体束流优化提供了参考。
上海软X射线自由电子激光 纵向相空间 阻抗壁尾场 能量分布畸变 SXFEL longitudinal phase space resistive wall wakefield energy distribution distortion 
强激光与粒子束
2022, 34(6): 064007
作者单位
摘要
中国工程物理研究院 流体物理研究所,四川 绵阳 621900
在一种猝发高重频的X射线自由电子激光(XFEL)装置中,由于受到光阴极注入器内补偿螺线管与电子枪之间特殊结构的限制,阴极附近电场与磁场为叠加状态。实验中需要对阴极热发射度进行测量,而测量热发射度常用的螺线管扫描法基于几何发射度不变的前提,无法直接应用于电磁场叠加的结构。针对这一问题,考虑到归一化过程可以剔除电场对发射度的影响,基于此,研究归一化相空间中应用的螺线管扫描法,并通过仿真计算与分析,最终证明该方法适用于电磁叠加场中阴极热发射度的测量。
热发射度 螺线管扫描法 相空间 电子枪 thermal emittance solenoid scan method phase space electron gun 
强激光与粒子束
2021, 33(2): 024003
作者单位
摘要
1 中国科学院合肥物质科学研究院,安徽 合肥 230031
2 中国科学技术大学 科学岛分院,安徽 合肥 230026
3 国防科技大学 前沿交叉学科学院,湖南 长沙 410073
无变形镜条件下抵抗大气湍流影响获取几百米至几十公里外目标的清晰成像和点云数据具有重要意义。光场相机是清晰成像和点云计算领域的有力工具,但是它在湍流条件下无法正常工作。同时光场相机技术的主要研究方向集中在如何提高点云的精度和密度,暂无人将其应用于湍流清晰成像。基于相空间光学原理改进了光场相机的信息提取算法,在湍流条件下完成了清晰成像和点云计算。这种算法使用四维密度函数来描述复眼结构,对原始数据的使用更加充分,能够提取物点完整的低阶相位信息,因而,可以抵抗湍流对局部子孔径的影响,稳健地获取目标点云,解算深度图并得到全聚焦清晰成像。根据这一原理设计了光场相机系统,探测室内湍流池后方的目标以及室外湍流下500 m处目标,均获得了4 k以上个物点的准确低阶相位分布,给出了目标的三维点云图和清晰成像。结果表明,该方法无需变形镜系统,也不需要先验信息,是一种稳定工作的解析算法。
去湍流清晰成像 三维点云 光场相机 相空间光学 turbulence-degraded image clarifications 3D point cloud calculation light field camera phase space optics 
红外与激光工程
2020, 49(11): 20200053
作者单位
摘要
1 中国科学院 上海应用物理研究所,上海 201800;中国科学院大学,北京 100049
2 中国科学院 上海高等研究院,上海 201204
3 中国科学院 上海应用物理研究所,上海 201800;中国科学院大学,北京 100049;中国科学院 上海高等研究院,上海 201204
4 中国科学院 上海应用物理研究所,上海 201800;中国科学院 上海高等研究院,上海 201204
下一代同步辐射光源储存环动力学孔径较小,因而束流注入困难,可以通过纵向束流注入解决这一问题。为了使用更长的kicker脉冲,有必要降低高频频率以增加注入束流到储存束流的时移。因为同步辐射运动,时移更长的束流有更高的动量偏差,所以通过该方法进行注入需要储存环提供足够大的能量接受度和动力学孔径。用SSRF-U的候选磁聚焦结构来展示纵向束流注入非线性优化的可行方法。由一系列高频频率的最佳结果可知,低于界限频率时kicker脉冲不会继续增长。在束流模拟中,采用界限频率与合适六级铁强度,可使SSRF-U储存环束流注入达到最高效率。
纵向束流注入 非线性优化 动力学孔径 同步辐射相位震荡 衍射极限环光源 longitudinal beam injection nonlinear optimization dynamic aperture synchrotron phase space diffraction-limited synchrotron light source 
强激光与粒子束
2019, 31(12): 125101
Author Affiliations
Abstract
1 State Key Laboratory of Nuclear Physics and Technology, and Key Laboratory of HEDP of the Ministry of Education, CAPT, Peking University, Beijing, 100871,China
2 Collaborative Innovation Center of Extreme Optics, Shanxi University, Taiyuan, Shanxi, 030006, China
The radiation reaction effects on electron dynamics in counter-propagating circularly polarized laser beams are investigated through the linearization theorem and the results are in great agreement with numeric solutions. For the first time, the properties of fixed points in electron phase-space were analyzed with linear stability theory, showing that center nodes will become attractors if the classical radiation reaction is considered. Electron dynamics are significantly affected by the properties of the fixed points and the electron phase-space densities are found to be increasing exponentially near the attractors. The density growth rates are derived theoretically and further verified by particle-in-cell simulations, which can be detected in experiments to explore the effects of radiation reaction qualitatively. The attractor can also facilitate realizing a series of nanometer-scaled flying electron slices via adjusting the colliding laser frequencies.
Radiation reaction effect Radiation reaction effect Phase space dynamics Phase space dynamics PIC simulation PIC simulation 
Matter and Radiation at Extremes
2016, 1(6): 308
作者单位
摘要
成都信息工程大学大气科学学院高原大气与环境四川省重点实验室, 四川 成都 610225
对不同湿度条件下消光系数序列演变特性的正确认知是构建大气颗粒物湿度订正模型的前提和基础。利用成都市人民南路4段环境监测站所提供的2013年6月到2014年5月逐时(降雨天除外)细颗粒物(PM2.5)浓度监测数据以及相应的地面能见度、相对湿度观测数据,反演得该区域相应时段单位质量消光系数时间序列。简要论述了消光系数吸湿过程中的复杂演变性及已有湿度订正模型的非普适性;基于相空间重构理论确定该时间序列的最佳延迟时间f和最佳嵌入维数m,据此计算出饱和关联维数、最大Lyapunov指数以及Kolmogorov熵特征量,其结果显示该序列具有低维混沌的特征;应用Cao方法排除其为非线性序列的可能性;结合替代数据法论证得成都市单位质量消光系数时间序列为随机序列。该研究结论不仅明晰了单位质量消光系数序列的特性,还为大气颗粒物湿度订正模型的改进奠定理论基础。
大气光学 随机特性 消光系数 相空间重构 替代数据法 
光学学报
2016, 36(8): 0801001
作者单位
摘要
1 河南师范大学物理与电子工程学院
2 河南师范大学新联学院 新乡 453007
3 新乡学院, 新乡 453007
借助于两模纠缠相干态,利用Wigner函数的定义和特性,通过严格的数学推导,首先获得了双阱势中玻色子正则规范粒子数差和位相差算符的Wigner函数,然后通过高斯光滑获得了它的Husimi函数。在准线性拉比规范下绘出了8个粒子9个本征态的相空间概率密度分布图;计算了随机变量-数差的均值和方差;从不同角度分析讨论了本征态的统计特性。发现数差的分布不同本征态有不同的结构,分别呈现单峰、双峰、三峰乃至多峰结构,峰的个数随着系统中粒子数的增加而增加;基态和最高激发态呈现单峰结构;且方差较小;分布于基态和最高激发态之间的态具有多峰结构;方差较大,最居中的态方差最大;而相位差的概率密度分布是周期函数,类似于光学里干涉条纹可见度分布,一个周期内总是呈现双峰结构,而且相位差的最可几概率仅有两种选择: 0、π和π/2、-π/2.
粒子数差和位相差正则共轭算符对 相空间 Husimi函数 双模哈密顿量 particle number difference-phase difference canoni phase space Husimi function two-mode Hamiltonian 
量子光学学报
2013, 19(4): 301
作者单位
摘要
第二炮兵工程大学,西安710025
针对平台误差系数建模预测问题,提出了基于多变量相空间重构的多输出高斯过程回归预测算法。通过多变量相空间重构将两个相关性较强的平台误差系数重构在一个相空间中,采用多输出高斯过程回归模型同时预测这两个平台误差系数。该算法充分利用了两个误差系数之间的相关性,提高了预测精度,而且可以得到任意置信度下的预测均值和置信区间,为解决平台误差系数建模预测提供一条新的途径。
多变量相空间重构 多输出高斯过程回归 平台误差系数 建模预测 multivariate phase space reconstruction multipleoutput Gaussian process regression platform error coefficient modeling and forecasting 
电光与控制
2013, 20(8): 84

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